兵部尚书金忠躬身奏言道：“那里地广人稀，若设置为郡县，因道路崎岖，怕是难以建立有效的管理。因此，臣以为我大明可以效法前汉，设置西域都督府治理西域。”
西域都护府是汉朝时期在西域设置的管辖机构，统管着大宛以东、乌孙以南的三十多个王国，各国“自译长、域长、君、监、吏、大禄、百长、千长、都尉、且渠、当户、将、相至侯王，皆佩汉印绶”，以汉王朝地方官员的身份治理西域。
至于西域都护，则是汉代西域官阶最高的官职，秩比二千石，相当于内地的郡都尉，而郡都尉是一郡之长太守的副职，掌管军事。
西域因地位特殊，故设“都护”，实际上与郡级区划相等。
西域都护府的主要职责在于守境安土，协调西域各王国间的矛盾和纠纷，制止外来势力的侵扰，维护西域境内的和平秩序，确保丝绸商路的畅通。
兵部侍郎齐泰却有不一样的意见，他躬身出列，奏言道：“陛下，鉴于西域地广人稀，被天山从中间分为南北两部分，臣以为当效法盛唐，设置安西都护府与北庭都护府，分治天山南北。”
武周长安二年，武则天为了进一步巩固西北边疆，在庭州设立了北庭都护府，辖境相当后世阿尔泰山以西，咸海以东，天山以北和巴里坤湖周围地区。
北庭都护府设立后，提携万里，社会安定、农业、牧业、商业、手工业都得到空前发展，成为西北地区中心。
九年后，北庭都护府升为大都护府，与安西都护府分治天山南北。
又两年后，即开元元年，第二任都护郭虔瑾进驻北庭后，将所率军队编为田卒、开荒种地、屯垦戍边。
“陛下，安西和北庭两个都护府作为唐王朝设在西域的最高一级军政衙门，使唐王朝在西域可以有效的任命各级官吏，统率边防守军，推行朝廷政令。”
齐泰躬身道：“设置两个都护府，一来可以巩固我大明在西北的边防，二来可以交通西域之西各国，三来可以在突发紧急军情时，两者之间互为依靠，以待朝廷援军。”
朱高煦听到这里，想到了设置两个都护府的第四个好处，即两者间为了治理各自辖区内的百姓，会进行竞争，如此则会加速朝廷对西域的建设与开发。
“金卿、齐卿，朕打算郡县西域，不打算设置都护府，你们什么意见？”
朱棣朗声问道。
金忠躬身答道：“臣赞成郡县西域。”
“臣附议。”齐泰躬身附和道。
“诸位臣工怎么看？”
朱棣环视殿内众臣，高声问道。
“臣等附议。”
其余众臣齐声道。
“既然如此，那朕想听听，诸位对于如何治理西域，有何建议？”
朱棣接着又问道。
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